Gần 10 năm kể từ lần đầu tiên làm việc với các đội tuyển trẻ quốc gia, huấn luyện viên Hoàng Anh Tuấn đến bây giờ mới giành danh hiệu đầu tiên. Nhà cầm quân người Khánh Hòa đưa U23 Việt Nam lên ngôi vô địch Đông Nam Á, điều ông chưa từng làm được trước đây khi dẫn dắt các đội tuyển U18, U19, U20.
U23 Việt Nam đánh bại U23 Indonesia trong loạt luân lưu.
Thành tích tốt nhất - tính theo thứ hạng - tại các giải đấu quốc tế chính thức của HLV Hoàng Anh Tuấn ở đội tuyển trẻ là á quân Đông Nam Á năm 2014. Khi đó, ông cùng lứa học trò Nguyễn Quang Hải, Nguyễn Trọng Đại... về nhì ở giải U19 Đông Nam Á với trận thua đậm 0-6 trước U19 Thái Lan ở chung kết.
Một năm sau, HLV Hoàng Anh Tuấn cùng U19 Việt Nam đứng thứ ba ở giải đấu khu vực.
Tuy nhiên, dù không giành danh hiệu trong gần 10 năm (trước lễ đăng quang tối qua 26/8), vị huấn luyện viên sinh năm 1968 vẫn đạt được thành tích lịch sử của bóng đá Việt Nam. Đó là khi HLV Hoàng Anh Tuấn dẫn dắt Quang Hải, Đoàn Văn Hậu... trong màu áo U19 Việt Nam và vào đến bán kết châu Á (xếp hạng 4 chung cuộc), giành quyền tham dự World Cup U17 - trở thành huấn luyện viên Việt Nam đầu tiên đưa đội đến đấu trường thế giới.
HLV Hoàng Anh Tuấn lần đầu tiên giành chức vô địch cùng đội tuyển trẻ Việt Nam.
Ông Hoàng Anh Tuấn không thành công với lứa cầu thủ tiếp theo - 2 lần liên tiếp không vượt qua vòng bảng giải Đông Nam Á. HLV người Khánh Hòa tạm nghỉ công việc huấn luyện các đội tuyển trẻ đến năm 2022, khi ông được bổ nhiệm dẫn dắt U17 Việt Nam sang Đức tập huấn, sau đó tiếp tục đảm nhiệm vai trò huấn luyện viên trưởng U20 Việt Nam.
Sau SEA Games 32, LĐBĐ Việt Nam (VFF) và HLV Philippe Troussier muốn triệu tập 2 đội hình U23 Việt Nam để tham dự các giải đấu khác nhau. HLV Hoàng Anh Tuấn được giao phụ trách đội tham dự giải U23 Đông Nam Á và ASIAD 19 với nòng cốt là những cầu thủ lứa U20.
Tại giải U23 Đông Nam Á 2023, U23 Việt Nam toàn thắng 4 trận. Thầy trò HLV Hoàng Anh Tuấn lần lượt vượt qua U23 Lào, U23 Philippines, U23 Malaysia và U23 Indonesia để bảo vệ thành công ngôi vô địch.