Sở Chỉ huy hoạt động 24/24h với nhiệm vụ tham mưu, dự báo tình huống, khả năng có thể xảy ra các cấp độ dịch COVID-19, hỗ trợ địa phương phòng, chống dịch.
Chỉ huy trưởng là Chủ tịch UBND TP.HCM Nguyễn Thành Phong. Phó chỉ huy thường trực là ông Phan Văn Mãi, Phó bí thư Thường trực Thành ủy TP.HCM.
Chủ tịch UBND TP.HCM Nguyễn Thành Phong.
Các phó chỉ huy khác gồm: Bà Tô Thị Bích Châu, Chủ tịch Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam TP.HCM; ông Nguyễn Hữu Hiệp, Trưởng ban Dân vận Thành ủy TP.HCM; ông Phan Nguyễn Như Khuê, Trưởng ban Tuyên giáo Thành ủy TP.HCM; ông Nguyễn Tấn Bỉnh, Giám đốc Sở Y tế TP.HCM và các Phó chủ tịch UBND TP.HCM gồm ông Dương Anh Đức, ông Ngô Minh Châu, ông Võ Văn Hoan.
Các thành viên của Sở Chỉ huy gồm: Tư lệnh Bộ Tư lệnh TP; Giám đốc Công an TP; Chỉ huy trưởng Bộ Chỉ huy Bộ đội Biên phòng TP; Chánh văn phòng UBND TP; Giám đốc Sở Công Thương; Giám đốc Sở Giao thông Vận tải; Giám đốc Sở Thông tin và Truyền thông.
Phó chủ tịch TP.HCM Ngô Minh Châu được giao phụ trách cơ quan Thường trực Sở Chỉ huy.
Sở Chỉ huy có trách nhiệm tham mưu, dự báo tình huống, khả năng có thể xảy ra các cấp độ dịch COVID-19; tiếp nhận, xử lý thông tin liên quan đến dịch và hoạt động lợi dụng tình hình dịch bệnh để trục lợi, phá hoại, gây mất an ninh trật tự. Đơn vị này cũng sẽ chủ động đề xuất chủ trương, kế hoạch, biện pháp phòng ngừa và ngăn chặn thông tin sai sự thật.
Sở Chỉ huy sẽ hướng dẫn phương án, kế hoạch phòng, chống dịch cho các địa phương; đồng thời, nghiên cứu, đề xuất kinh phí mua sắm trang thiết bị phòng, chống dịch.