Tháng 6/2016, Lê Tấn Hùng, Tổng Giám đốc SAGRI Nguyễn Thị Thuý (Trưởng phòng Tài chính Kế toán kiêm kế toán trưởng) và Nguyễn Thị Tuyết Mai (Trưởng phòng Nhân sự hành chính liên hệ, gặp gỡ, bàn bạc với Trần Văn Trường, Giám đốc và Đỗ Sĩ Hoài Thanh, kế toán trưởng Công ty du lịch thanh niên xung phong (hay còn có tên gọi khác là Công ty VYC); Đoàn Quang Hồi, Giám đốc và Nguyễn Thị Nguyên, kế toán trưởng Công ty TNHH Thương mại dịch vụ Lữ hành Hoà Bình Quốc tế (PIT) lập hồ sơ ký khống 10 hợp đồng tham quan, học tập kinh nghiệm ở nước ngoài để tham ô 13.346.900.000 đồng.
Ký khống 6 hợp đồng với Công ty VYC chiếm đoạt hơn 4 tỷ đồng
Cuối tháng 8/2016, Lê Tấn Hùng yêu cầu Nguyễn Thị Thuý báo cáo kết quả hoạt động kinh doanh dự kiến 3 quý đầu năm và dự kiến lợi nhuận năm 2016 của SAGRI.
Sau khi nghe Thuý báo cáo, thấy kết quả kinh doanh của SAGRI vượt chỉ tiêu do UBND TP.HCM giao, Hùng gọi điện cho Trần Văn Trường đến trao đổi thống nhất lên chương trình ký hợp đồng trị giá khoảng 5 tỷ đồng.
Bị can Lê Tấn Hùng.
Việc trao đổi lên kế hoạch ký hợp đồng được Thuý, Trường, Mai trao đổi qua email, đến ngày 17/11/2016 thì kết thúc trao đổi và các bên thống nhất ký 6 hợp đồng trị giá 4.970.900.000 đồng.
Từ 25/11 đến 9/12/2016, Lê Tấn Hùng và Nguyễn Thị Thuý đã ký 6 lệnh chi chuyển cho Công ty VYC số tiền 4.970.900.000 đồng, tương ướng theo giá trị 6 hợp đồng bao gồm: Hợp đồng số 179/HĐDL-VYC (ngày 5/9/2016), hợp đồng số 180/HĐDL-VYC (ngày 5/9/2016), hợp đồng số 187/ HĐDL-VYC (ngày 27/9/2016), hợp đồng số 177/ HĐDL-VYC (ngày 3/10/2016), hợp đồng số 178/ HĐDL-VYC (ngày 3/10/2016) và hợp đồng số 188/ HĐDL-VYC (ngày 21/10/2016).
Ngày 30/11/2016, Công ty VYC xuất hoá đơn GTGT số 4073, 4074 cho SAGRI.
Ngày 9/12/2016, Lê Tấn Hùng và Nguyễn Thị Thuý đã ký lệnh chi số 1034 chuyển số tiền 718.800.000 đồng cho Công ty VYC và hai bên đã ký bản thanh lý hợp đồng ghi ngày 12/12/2016.
Sau khi thanh toán, Hùng chỉ đạo Thuý và Mai liên hệ với Công ty VYC để lấy hết tiền về gửi tiết kiệm, tuy nhiên Trần Văn Trường chỉ đồng ý chuyển lại 70% số tiền SAGRI đã chuyển.
Ngày 27/1/2016, theo chỉ đạo của Hùng, Mai đã chỉ đạo Lê Thị Diệp Cẩm và Nguyễn Thị Thuý đến Công ty VYC nhận tiền theo thoả thuận. Sau khi nhận được tiền, Thuý cùng Cẩm đến ngân hàng Sacombank (Quận 1, TP.HCM) mở sổ tiết kiệm. Tiếp đó, Hùng chỉ đạo Thuý, Mai, Cẩm rút toàn bộ số tiền đã gửi tiết kiệm.
Để che dấu việc lập hồ sơ khống thanh toán tiền tham quan du lịch năm 2016, Hùng và các bị can thống nhất với Công ty VYC tổ chức cho 36 lượt cán bộ, công nhân viên SAGRI năm 2017 đi du lịch tại Nhật Bản, với tổng số tiền 1.579.640.000 đồng. Tuy nhiên không chuyển tiền cho Công ty VYC mà lấy số tiền Công ty VYC giữ lại năm 2016 để thanh toán. Đồng thời, Hùng chỉ đạo Mai, Thuý, Cẩm chuyển 3.515.990.000 đồng cho Đỗ Sĩ Hoài Thanh.
Ký khống 4 hợp đồng với Công ty PIT chiếm đoạt hơn 8 tỷ đồng
Theo kết luận điều tra, tháng 10/2016, Nguyễn Thị Nguyên (là em gái ruột Nguyễn Thị Thuý, kế toán trưởng Công ty PIT) trao đổi với Thuý xin Lê Tấn Hùng cho ký hợp đồng với Công ty PIT. Sau đó, Thuý báo áo với Hùng và được Hùng đồng ý ký 4 hợp đồng trị giá từ 7-8 tỷ đồng.
Trước khi ký hợp đồng, Thuý trao đổi với Nguyên sau khi SAGRI thanh toán thì sẽ nhận tiền về, Nguyên đã báo cáo Đoàn Quang Hồi (Giám đốc Công ty PIT) và thống nhất đồng ý chuyển lại cho SAGRI 70%, 30% còn lại Công ty PIT giữ.
Sau đó, Công ty PIT giao cho Nguyên và Đoàn Thị Ngọc Quý dự thảo 4 hợp đồng trị giá 8.376.000.000 đồng.
Cụ thể, ngày 3/10/2016, Lê Tấn Hùng cùng Đoàn Quang Hồi ký hợp đồng số 211016/PIT-DLNN với nội dung “Tổ chức đi tham quan, học tập kinh nghiệm tại Mỹ, thời gian 11 ngày 10 đêm. Ngày khởi hành 21/10/2016, ngày kết thúc 31/10/2016, số lượng khách 30 người, tổng giá trị hợp đồng 2.400.000.000 đồng".
Ngày 6/10/2016, tiếp tục ký hợp đồng trị giá 1.400.000.000 đồng với nội dung “Tổ chức đi tham quan, học tập kinh nghiệm tại nước Nhật”.
Đến ngày 25/10/2016, ký tiếp hợp đồng số 041116/ PIT-DLNN có giá trị 3.496.000.000 đồng, với nội dung “Tổ chức chương trình tham quan, học tập kinh nghiệm tại Ý, Pháp, Hà Lan, Bỉ”.
Ngày 1/11/2016, Lê Tấn Hùng và Đoàn Quang Hồi ký hợp đồng số 141116/PIT-DLNN có giá trị 1.080.000.000 đồng, với nội dung “Tổ chức chương trình tham quan, học tập kinh nghiệm tại Hàn Quốc”.
Sau khi thực hiện “giao dịch” xong, Hùng đã chỉ đạo Mai và Thuý liên hệ với Công ty PIT để nhận lại 70% số tiền hợp đồng thoả thuận.
Ngày 16/12/2016, Hương (thủ quỹ Công ty PIT) rút 8,4 tỷ đồng và giao cho Mai 5.863.200.000 đồng. Sau khi nhận đủ tiền, Mai đứng tên mở 2 sổ tiết kiệm tại ngân hàng ACB chi nhánh Sài Gòn.
Từ 19/4/2017 đến 21/7/2017, Hùng chỉ đạo Mai và Thuý rút toàn bộ số tiền đã gửi tiết kiệm.
Như VTC News đưa tin, ngày 6/3, Cơ quan CSĐT Bộ Công an ban hành kết luận điều tra vụ án sai phạm xảy ra tại Tổng công ty Nông nghiệp Sài Gòn (SAGRI).
Theo kết luận điều tra, bị can Lê Tấn Hùng (SN 1963, nguyên Tổng Giám đốc Tổng Công ty Nông nghiệp Sài Gòn - SAGRI) và Nguyễn Thị Thúy (SN 1966, Kế toán trưởng) bị đề nghị truy tố về tội tham ô và vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản gây thất thoát lãng phí.
Các bị can Trần Văn Trường, Đỗ Sĩ Hoài Thanh, Đoàn Quang Hồi, Nguyễn Thị Nguyên và Nguyễn Thị Tuyết Mai bị đề nghị truy tố tội tham ô tài sản.
Các bị can bị đề nghị truy tố về tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản gây thất thoát lãng phí gồm: Vân Trọng Dũng (SN 1967, Chủ tịch Hội đồng thành viên SAGRI), Trần Vĩnh Tuyến (SN 1965, nguyên Phó Chủ tịch UBND TP.HCM), Trần Trọng Tuấn (SN 1969, Phó Chánh văn phòng Thành uỷ TP.HCM), Phan Trường Sơn, Trần Quốc Đạt, Lê Tấn Hòa, Lê Văn Thanh và Nguyễn Thanh Chương.
Bị can Nguyễn Thị Thanh An (SN 1967, nguyên kiểm soát viên SAGRI) bị đề nghị truy tố về tội thiếu trách nhiệm.
Trong vụ án này, Cơ quan CSĐT Bộ Công an xác định ông Lê Tấn Hùng là chủ mưu, vừa chỉ đạo điều hành vừa là người thực hiện tội phạm, gây thiệt hại cho Nhà nước số tiền đặc biệt lớn.