Đối tượng tuyển sinh của trường THPT chuyên Khoa học Tự nhiên năm nay là học sinh tốt nghiệp THCS năm 2021 trên phạm vi toàn quốc. Thí sinh cần phải đáp ứng điều kiện xếp loại hạnh kiểm, học lực cả năm học của các lớp cấp THCS từ khá trở lên; xếp loại tốt nghiệp THCS từ khá trở lên. Các điều kiện này sẽ được kiểm tra khi thí sinh trúng tuyển nhập học.
Trường sẽ tuyển học sinh vào các lớp chuyên Toán, chuyên Tin, chuyên Lý, chuyên Hóa, chuyên Sinh và Chất lượng cao, mỗi khối lớp 90 em.
Thí sinh dự thi lớp 10 THPT chuyên Khoa học tự nhiên phải làm bài thi viết 3 môn: Ngữ văn, Toán (vòng 1) và môn chuyên (các môn chuyên: môn Toán (vòng 2) cho thí sinh thi vào chuyên Toán học và chuyên Tin học; môn Vật lý cho thí sinh thi vào chuyên Vật lý; môn Hoá học cho thí sinh thi vào chuyên Hoá học và môn Sinh học cho thí sinh thi vào chuyên Sinh học).
Đề thi được xây dựng theo hình thức tự luận đối với môn Toán (vòng 1) và các môn chuyên; trắc nghiệm kết hợp với tự luận đối với môn Ngữ văn. Thời gian làm bài thi môn Ngữ văn, môn Toán (vòng 1) 90 phút, môn chuyên 120 phút. Thang điểm thi tính theo thang điểm 10.